QiEP · Pràctica 2 · 2025-2026

Presentació

Pràctica d'exploració de mètodes d'enginyeria de proteïnes.

Calendari de referència segons el pla de treball 2025-2026:

• Desenvolupament principal: de la setmana 11 a la setmana 15 del curs, del 20 d'abril al 24 de maig de 2026.
• Lliurament definitiu: setmana 15, del 18 al 24 de maig de 2026.

Objectius

• Conèixer les eines experimentals i computacionals habituals en el camp de l'enginyeria de proteïnes, i especialment en evolució dirigida.
• Usar amb criteri les representacions gràfiques d'estructures de proteïnes.
• Saber contextualitzar el treball en enginyeria de proteïnes que es desenvolupa a l'acadèmia i a la indústria.
• Aprendre a dissenyar protocols experimentals per a l'optimització d'una nova forma proteica amb propietats rellevants.
• Treballar en equip.
• Desenvolupar habilitats digitals en la presentació de resultats.

Temporització segons el pla de treball 2025-2026

• Setmana 11 (20/04/2026-26/04/2026): inici de la pràctica 2 i treball autònom. Coincideix amb el lliurament de la pràctica 1.
• Setmana 12 (27/04/2026-03/05/2026): continuació de la pràctica 2.
• Setmana 13 (04/05/2026-10/05/2026): pràctica 2, estudi de la teoria i treball del Journal Club.
• Setmana 14 (11/05/2026-17/05/2026): pràctica 2, estudi de la teoria i treball de casos pràctics.
• Setmana 15 (18/05/2026-24/05/2026): segona i tercera sessió de la pràctica 2; entrega definitiva.

Lliurament de la pràctica 2: setmana 15 del curs, entre el 18 i el 24 de maig de 2026, segons el pla de treball compartit.

Desenvolupament

La pràctica es desenvolupa al llarg de diverses setmanes dins del calendari del curs 2025-2026. Hi haurà una sessió inicial de presentació i orientació del treball, i un seguiment posterior per ajudar-vos a concretar el protocol experimental i computacional que proposeu.

• Feina interna del grup: cada grup `JC A-L` treballarà sobre la proteïna que té assignada a l'aula Moodle i sobre el mètode d'enginyeria que se li hagi indicat.
• Integració de continguts: el document final haurà de relacionar el cas escollit amb les metodologies d'enginyeria de proteïnes tractades al curs.

Recursos recomanats per preparar la proposta

Lliurament

El lliurament consisteix en un únic document comprimit (.zip) que ha d'incloure:

• un únic fitxer en format Markdown amb les respostes;
• una carpeta amb les imatges i altres elements que estiguin vinculats al fitxer Markdown.

El document ha de presentar una proposta raonada d'enginyeria de proteïnes aplicada a la proteïna assignada, incloent-hi la justificació del problema, el context bibliogràfic, la descripció del mètode o conjunt de mètodes escollits, i la discussió dels resultats esperables o dels criteris d'avaluació del protocol proposat.

Recordeu afegir peus de figura descriptius a les figures que inclogueu i referenciar-les de forma adient des del text. Les figures poden ser esquemes propis, representacions estructurals o fluxos de treball, sempre que quedin ben justificats dins del document.

Detalls pràctics

• Les referències bibliogràfiques del treball han de provenir preferentment d'articles peer-reviewed i de bases de dades especialitzades.
• Si un article no està disponible directament en línia, cerqueu-lo primer a UCercaTot, el cercador de la Biblioteca de la UVic-UCC. Si encara no hi teniu accés a text complet, el podeu sol·licitar a través del Servei d'Obtenció de Documents de la Universitat.
• No baseu el treball en pàgines generalistes; useu literatura científica, patents o recursos tècnics pertinents segons el cas.
• El fitxer Markdown ha de contenir cites de la literatura en el format adient. Us recomanem usar Zotero o Mendeley com a eines de gestió de referències.

Avaluació

La pràctica s'avaluarà fent la mitjana de dues notes, de manera anàloga a la pràctica 1:

• Sobre el treball fet al grup JC: una avaluació de la qualitat del protocol i del document presentat, segons la rúbrica proposada.
• Sobre la comprensió dels diferents treballs presentats: la mitjana de les notes del test d'elecció múltiple vinculat a la pràctica en el tercer examen parcial dels diferents membres de cada grup `JC A-L`.

La guia general sobre com escriure una bona memòria, gestionar la bibliografia i organitzar el flux de treball digital és disponible a la pàgina general de QiEP. Els documents de suport i la bibliografia comuna del curs són disponibles a la pàgina del curs 2025-2026.