QiEP · Pràctica 2 · 2025-2026

Presentació

Pràctica d'exploració de mètodes d'enginyeria de proteïnes.

Calendari de referència segons el pla de treball 2025-2026:

Desenvolupament principal: de la setmana 11 a la setmana 15 del curs, del 20 d'abril al 24 de maig de 2026.
Lliurament definitiu: setmana 15, del 18 al 24 de maig de 2026.

Objectius

Conèixer les eines experimentals i computacionals habituals en el camp de l'enginyeria de proteïnes, i especialment en evolució dirigida.
Usar amb criteri les representacions gràfiques d'estructures de proteïnes.
Saber contextualitzar el treball en enginyeria de proteïnes que es desenvolupa a l'acadèmia i a la indústria.
Aprendre a dissenyar protocols experimentals per a l'optimització d'una nova forma proteica amb propietats rellevants.
Treballar en equip.
Desenvolupar habilitats digitals en la presentació de resultats.

Temporització segons el pla de treball 2025-2026

Setmana 11 (20/04/2026-26/04/2026): inici de la pràctica 2 i treball autònom. Coincideix amb el lliurament de la pràctica 1.
Setmana 12 (27/04/2026-03/05/2026): continuació de la pràctica 2.
Setmana 13 (04/05/2026-10/05/2026): pràctica 2, estudi de la teoria i treball del Journal Club.
Setmana 14 (11/05/2026-17/05/2026): pràctica 2, estudi de la teoria i treball de casos pràctics.
Setmana 15 (18/05/2026-24/05/2026): segona i tercera sessió de la pràctica 2; entrega definitiva.

Lliurament de la pràctica 2: setmana 15 del curs, entre el 18 i el 24 de maig de 2026, segons el pla de treball compartit.

Desenvolupament

La pràctica es desenvolupa al llarg de diverses setmanes dins del calendari del curs 2025-2026. Hi haurà una sessió inicial de presentació i orientació del treball, i un seguiment posterior per ajudar-vos a concretar el protocol experimental i computacional que proposeu.

Feina interna del grup: cada grup `JC A-L` treballarà sobre la proteïna que té assignada a l'aula Moodle i sobre el mètode d'enginyeria que se li hagi indicat.
Integració de continguts: el document final haurà de relacionar el cas escollit amb les metodologies d'enginyeria de proteïnes tractades al curs.

Lliurament

El lliurament consisteix en un únic document comprimit (.zip) que ha d'incloure:

un únic fitxer en format Markdown amb les respostes;
una carpeta amb les imatges i altres elements que estiguin vinculats al fitxer Markdown.

El document ha de presentar una proposta raonada d'enginyeria de proteïnes aplicada a la proteïna assignada, incloent-hi la justificació del problema, el context bibliogràfic, la descripció del mètode o conjunt de mètodes escollits, i la discussió dels resultats esperables o dels criteris d'avaluació del protocol proposat.

Recordeu afegir peus de figura descriptius a les figures que inclogueu i referenciar-les de forma adient des del text. Les figures poden ser esquemes propis, representacions estructurals o fluxos de treball, sempre que quedin ben justificats dins del document.

Detalls pràctics

Les referències bibliogràfiques del treball han de provenir preferentment d'articles peer-reviewed i de bases de dades especialitzades.
Si un article no està disponible directament en línia, cerqueu-lo primer a UCercaTot, el cercador de la Biblioteca de la UVic-UCC. Si encara no hi teniu accés a text complet, el podeu sol·licitar a través del Servei d'Obtenció de Documents de la Universitat.
No baseu el treball en pàgines generalistes; useu literatura científica, patents o recursos tècnics pertinents segons el cas.
El fitxer Markdown ha de contenir cites de la literatura en el format adient. Us recomanem usar Zotero o Mendeley com a eines de gestió de referències.

Avaluació

La pràctica s'avaluarà fent la mitjana de dues notes, de manera anàloga a la pràctica 1:

Sobre el treball fet al grup JC: una avaluació de la qualitat del protocol i del document presentat, segons la rúbrica proposada.
Sobre la comprensió dels diferents treballs presentats: la mitjana de les notes del test d'elecció múltiple vinculat a la pràctica en el tercer examen parcial dels diferents membres de cada grup `JC A-L`.

La guia general sobre com escriure una bona memòria, gestionar la bibliografia i organitzar el flux de treball digital és disponible a la pàgina general de QiEP. Els documents de suport i la bibliografia comuna del curs són disponibles a la pàgina del curs 2025-2026.