Bioinformàtica estructural
Estudi de la seqüència, l'estructura i la funció de les proteïnes
Aquesta web reuneix materials docents per entendre com la informació de seqüència es transforma en estructura tridimensional i, finalment, en funció biològica. El lloc queda organitzat en dos blocs principals: els tallers i l'assignatura de Química i Enginyeria de Proteïnes (QiEP) de la FCTE al Grau en Biotecnologia.
Materials desenvolupats en el context docent de la FCTE i la UVic-UCC per treballar relacions seqüència-estructura-funció de proteïnes amb eines de bioinformàtica, visualització molecular i anàlisi estructural.
Bloc 1
Tallers
Recull de tallers guiats per introduir conceptes d'estructura de proteïnes, interacció molecular i disseny racional de fàrmacs. Inclou materials per a alumnat i professorat.
Taller COVID-19 per a alumnat
Guió interactiu per estudiar la interacció virus-cèl·lula, la variabilitat i el disseny racional de fàrmacs.
Taller COVID-19 per a professorat
Versió docent del taller, amb materials i recorregut per conduir l'activitat.
Assignment UI
Versió en anglès del taller sobre disseny racional de fàrmacs aplicada a la COVID-19.
Solució UI
Material de suport i solucions de la proposta internacional.
Bloc 2
Química i Enginyeria de Proteïnes
Espai docent de l'assignatura QiEP de la FCTE al Grau en Biotecnologia. Inclou enunciats, guions de pràctica i treballs de curs organitzats per edició.
Curs 2022-2023
Primera edició disponible del material de QiEP, centrada en l'anàlisi estructura-funció de proteïnes.
Curs 2024-2025
Material del curs 2024-2025 i treballs dels grups del curs.
Curs 2025-2026
Accés a les pràctiques 1 i 2 del curs 2025-2026, amb temporització, desenvolupament i avaluació.
Fil conductor
Què s'hi treballa
Seqüència
Identificació de proteïnes, anotació funcional, cerca a UniProt i anàlisi de motius i dominis.
Estructura
Exploració de plegaments, estructures secundària, terciària i quaternària amb PDB, AlphaFold i visualitzadors moleculars.
Funció
Interpretació de centres actius, interaccions proteïna-lligand i relacions moleculars que expliquen la funció biològica.