QIEP
QiEP · Curs 2024-2025
Context docent
El curs 2024-2025 es va dedicar principalment a l'anàlisi d'una proteïna problema per relacionar la seva seqüència, la seva estructura i la seva funció. L'activitat combinava consulta de bases de dades, visualització molecular i interpretació funcional.
Desenvolupament de la pràctica
- Identificar la proteïna a partir de la seqüència i anotar-ne el gen, el codi UniProt, l'activitat enzimàtica i el context funcional.
- Determinar l'estructura disponible al PDB o, si cal, recórrer a prediccions estructurals com AlphaFold.
- Descriure estructures secundària, motius supersecundaris, plegament i eventual estructura quaternària.
- Interpretar el centre actiu, les interaccions rellevants i la relació molecular entre estructura i funció.
Repositori de proteïnes analitzades
Aquestes entrades parteixen dels treballs dels estudiants i els transformen en material científic consultable: identitat de la proteïna, estructura, funció, mecanisme i figures comentades.
Flavin-containing monooxygenase 5
FMO5
Glutatió S-transferasa GstA
GST; EC 2.5.1.18
Cutinasa
Hidrolasa d'èsters
Fenilalanina amoni-liasa
PAL; cofactor MIO
Sucrosa isomerasa
Isomerització de sucres
DNA ligasa
Reparació i unió de DNA
Traslocasa SecA
ATPasa de translocació
Amina oxidasa
Oxidació d'amines
Glicosiltransferasa
Transferència de sucres
Epoxi hidrolasa microsomal 1
EPHX1
Pectat liasa
Degradació de pectines
Xilosa isomerasa
Isomerització aldosa-cetosa
Lipasa
Hidròlisi d'èsters lipídics
Recursos per llegir els treballs
Tutorial PFAM
Ajuda a contextualitzar dominis i famílies que apareixen repetidament en els treballs.
Exemples d'estructures
Complement útil per comparar tipus de plegament, motius i anàlisi funcional.
Guia per escriure una memòria
Criteris generals per entendre millor l'organització i l'estil esperables dels lliuraments.